Macでfastaファイルをダウンロードする方法
DVDをmacに保存しておきましょう。Macを持っているのですから、大切なDVDが破損する前に、大切なDVDをmacに保存しておきましょう。オリジナルは大切なコレクションとして保存し、普段はmacに保存したDVDファイルを利用します。 プライバシー重視の社会においては、個人情報を守るために見られてはいけないファイルをよくストレージすることは必要なのです。この記事は「Hidata」でファイルに鍵をかける方法を説明いたします。 2017/04/25
再開するには、「再開」ボタン をクリックします。 ダウンロードした項目をMacで検索する: ダウンロードリストのファイル名の横にある虫眼鏡 をクリックします。ファイルを
2017/06/21 2019/09/27
2017年8月10日 この方法を使うことで、配列を1個1個コピー&ペーストすることなく、まとめて配列を取得することができます。例として使用した YouTube版を視聴できない方はオリジナル版ファイル(mov形式)をダウンロードして、ご覧ください。 オマケとして、Multi FASTAファイルから注釈行のみを取り出す方法やエントリIDのリストを取得する方法を、Mac OSXに標準でインストールされている「ターミナル」を使って説明しています。
以前、X11をインストールするにはOSを再インストールしなくてはいけません、と書いてましたが、上記の方法でOSの再インストールをする ダウンロードしたファイルをダブルクリックすると解凍されて「blast-2.2.14」フォルダができるので、「blast-2.2.14/bin/」の中身を全部「foo/bin/」へコピーします。 ここではNCBIのftpサイト「blast/db/FASTA/」にある大腸菌の配列「ecoli.aa.gz (アミノ酸配列)」と「ecoli.nt.gz (核酸配列)」を例にします。 2013年3月22日
インストールするソフトウェアのバージョンが異なる場合は書き換えてください. # ${HOME} ここではGenomon-fusionパイプラインが呼び出すデータセットのダウンロードの方法が記載されています. 各データセットの UCSC が公開しているhg19 FASTAファイルをダウンロードして RNAseq/ref/hg19/major ディレクトリに配置します. # Change
FASTAファイルをダウンロードするか作成します。ここではファイル名はtestdb.fastaと仮定します。 testdb.fastaをC:\blast\dbディレクトリにWindowsエクスプローラでコピーします。 コマンドプロンプトを開きます。 "cd C:\blast\db"と入力します。 複数のファイルをまとめてダウンロードする時や、フォルダを丸ごとダウンロードしたい時は、「zip としてダウンロード」を選択するとよいでしょう。 目次へ戻る ② 解析するシークエンスファイル(テキストファイル)を選択する。 *自分でテキストファイルを作成する場合はfasta 形式にする(図4)。 図4 “>”の後に配列の名前を入れ、改行して塩基配列を ペーストする。 Excelでテキストファイルを開くと、[テキストファイルウィザード]が起動します。ここでタブやスペースなどの区切り文字を設定すると、データを各セルに分割して読み込めます。 ダウンロードされるのはsraファイルなので、fastq形式に変換する。 分からなかったら"sra fastq 変換"とググれば良い。 使うコマンドはfastq-dump。ファイル名を指定するだけ。 sraファイルがおいてあるフォルダにcdを使って移動するのを忘れずに。 ファイルには複数のFASTAデータを入力できます。ここではファイル名は test_dna.fastaとtest_protein.fastaと仮定します。nt.00はDNAデータベースでnr.00はタンパク質データベー スです。いずれも ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/ からダウンロードできます。 これらの 解析するとfastaファイルがたくさん出力されるので、それぞれを一つのファイルに統合します。 前回と同様に始めにターミナルを開き、fastaファイルが入っている場所までcd(CD)コマンドで移動します。 次に統合するために以下のコードを打ちます。 Mac, Linux
MacのSafariアプリケーション で、Safariウインドウの右上隅付近にある「ダウンロードを表示」ボタン をクリックします。ダウンロードリストが空の場合、このボタンは表示されません。以下のいずれかの操作を行います: ダウンロードを一時停止する: ダウンロードリストのファイル名の右にある
Macの「メール」アプリケーション で、添付ファイルを含むメッセージを選択します。メッセージリストの差出人名の横に添付ファイルアイコン が表示されています。そのメッセージで以下のいずれかの操作を行います: アプリケーションで添付ファイルを開く: 添付ファイルをダブルクリックし 2016/10/31 2017/05/23